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PAM的分子量很高，且近年來還有較大提高。20世紀70年代應用的PAM，分子量一般為數百萬;80年代以后，多數優質PAM的分子量在1500萬以上，有些達到2000萬。每一個這種PAM分子是由十萬個以上的丙烯酰胺或丙烯酸鈉分子聚合而成(丙烯酰胺的分子量為71，含十萬個單體的PAM的分子量為710萬)。通常，分子量高的PAM的絮凝性能較好，丙烯酰胺的分子量為71，含十萬個單體的PAM的分子量為710萬。

聚丙烯酰胺及其衍生物的分子量從幾十萬到一千萬以上，根據分子質量可分為低分子量(100萬以下)、中分子量(100萬~1000萬)、高分子量(1000萬~1500萬)、超分子量(1500萬以上)。

PAM的離子度對它的使用效果有很大影響，但它的適宜數值需視所處理的物料的種類和性質而定，不同情況下會有不同的較佳值。如果所處理的物料的離子強度較高(含無機物較多)，所用PAM的離子度宜較高，反之則應較低。通常，陰離子度被稱為水解度。而離子度一般特指陽離子。